Se a aquisição de um imóvel for detida numa empresa, ou seja, uma entidade empresarial, a transação envolve normalmente a compra da participação dos vendedores nas ações da empresa. Nestes casos, e por norma, as entidades empresariais estão sediadas em Malta ou Delaware, por exemplo, onde a transação está sujeita à jurisdição local. Recentemente, temos visto algumas destas entidades não residentes a serem redomiciliadas em Portugal, criando, consequentemente, uma entidade residente. Em qualquer dos casos, o seu advogado não só fará as pesquisas necessárias em Portugal, junto das respetivas entidades acima mencionadas, como também irá investigar o historial da empresa, com a colaboração da empresa que gere a participação, e efetuar as devidas diligências.

Uma vez aprovado, será redigido um contrato de compra e venda de ações e será pago o depósito acordado. A conclusão da transação é acordada entre os advogados de ambas as partes e, uma vez que não se trata de uma escritura notarial, os impostos habituais associados à propriedade pessoal não são aplicáveis à empresa não residente (Atualmente 7,5% de imposto sobre a compra mais 0,8% de imposto de selo sobre propriedades cujo valor da escritura exceda 1.050.400€. Qualquer valor inferior está sujeito a taxas variáveis. Ver secção sobre os custos de aquisição).

Desde 2018, é obrigatório informar as respetivas autoridades sobre a mudança de acionista(s), seja no seio de uma empresa residente ou de uma empresa não residente. O governo português considera qualquer ganho resultante da venda de uma empresa como rendimento gerado em Portugal. No entanto, dependendo da residência fiscal do beneficiário, poderão aplicar-se exceções.